27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02037 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  58.47 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  58.19 
 
 
236 aa  301  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  52.52 
 
 
244 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  54.59 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  47.37 
 
 
232 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  52.94 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  52.94 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  30.99 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4868  hypothetical protein  26.79 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0256535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 
515 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 
515 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  27.73 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  27.7 
 
 
242 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  30.23 
 
 
192 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  26.76 
 
 
525 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  27.66 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  28.99 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  25.55 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  38.16 
 
 
510 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38235  predicted protein  22.22 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  25.5 
 
 
528 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  25.48 
 
 
485 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  31.4 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  32.04 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  34.09 
 
 
202 aa  42  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  35.56 
 
 
204 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>