36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0168 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  57.14 
 
 
234 aa  293  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  51.3 
 
 
237 aa  254  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  50.88 
 
 
236 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  49.78 
 
 
244 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  47.37 
 
 
237 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  51.54 
 
 
187 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  51.54 
 
 
187 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4868  hypothetical protein  25.41 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0256535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  26.11 
 
 
515 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  31.09 
 
 
631 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  35.48 
 
 
510 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  27.04 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  26.11 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  25.13 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  25 
 
 
265 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  25.97 
 
 
225 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  25.47 
 
 
288 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  31.11 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  23.81 
 
 
271 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  31.34 
 
 
742 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  28.89 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  26.44 
 
 
515 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  33.93 
 
 
742 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  33.93 
 
 
742 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  33.93 
 
 
742 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  34.83 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.77 
 
 
571 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  29.7 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  33.93 
 
 
742 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
528 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  32.43 
 
 
635 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  26.25 
 
 
343 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>