45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2576 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  58.97 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  57.63 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  57.46 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  52.52 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  49.78 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  29.32 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.1 
 
 		 515 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 		 631 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.53 
 
 		 571 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  28.68 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  33.7 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4868  hypothetical protein  21.88 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0256535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  22.84 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  32.22 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  22.06 
 
 		 492 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  26.28 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  31.45 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  30.85 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  29.35 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  27.07 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1644  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 		 379 aa  45.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  25.18 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38235  predicted protein  25 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  32.05 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  31.37 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  34.45 
 
 		 742 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  34.45 
 
 		 742 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  24.44 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  26.85 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  24.17 
 
 		 478 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  27 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.89 
 
 		 744 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  30.11 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  27.1 
 
 		 283 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>