17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3625 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  56.79 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  54.9 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  52.94 
 
 		 237 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  57.14 
 
 		 237 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  51.54 
 
 		 232 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  30.11 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  33 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 		 235 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  31.13 
 
 		 283 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  30.53 
 
 		 280 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  32.41 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 525 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  31.58 
 
 		 275 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>