48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1654 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  80.85 
 
 
236 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  58.47 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  57.63 
 
 
244 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  55.84 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0168  transglutaminase domain-containing protein  51.3 
 
 
232 aa  254  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3625  hypothetical protein  57.14 
 
 
187 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937434  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3963  hypothetical protein  57.14 
 
 
187 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  28.72 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  31.39 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4868  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0256535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  28.47 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  29.8 
 
 
500 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38235  predicted protein  27.74 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  27.62 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30.34 
 
 
515 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 
510 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  31.13 
 
 
310 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  32.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  30.34 
 
 
515 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  31.25 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  31.9 
 
 
528 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  30.19 
 
 
283 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
515 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  30.19 
 
 
277 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  28.79 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 
822 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.68 
 
 
327 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  27.86 
 
 
631 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  26.87 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  30.39 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
485 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  34.85 
 
 
492 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  31.65 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  31.96 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  28.3 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  25.37 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  32.29 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  34.41 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  28.95 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  43.33 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  38.16 
 
 
523 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  28.57 
 
 
818 aa  42  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  26.06 
 
 
645 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>