36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4183 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  72.81 
 
 		 220 aa  341  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  69.27 
 
 		 223 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  53.85 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  65.62 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  45.81 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  44.98 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  50.27 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  42.52 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  42.79 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  45.32 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  45.32 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  45.32 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  44.1 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  44.76 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  44.72 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  42.79 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  40.59 
 
 		 210 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  29.46 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  24.41 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.52 
 
 		 634 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  26.27 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 		 515 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 		 515 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  32.58 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  26.03 
 
 		 366 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  25.5 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  27.88 
 
 		 492 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  27.13 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  26.92 
 
 		 485 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  23.57 
 
 		 484 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>