59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1465 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  85.09 
 
 		 232 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  80 
 
 		 236 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  46.12 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  44.81 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  46.7 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  48.31 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  46.4 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  45.45 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  42.79 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  45.73 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  46.03 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  46.03 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  46.03 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  39.91 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  44.16 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  46.15 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  32.65 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  34.02 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 		 366 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 		 492 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  29.77 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.28 
 
 		 1305 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  27.04 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.56 
 
 		 392 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  34.83 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30.67 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  30.97 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  29.71 
 
 		 478 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  29.2 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  32.09 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  34.09 
 
 		 515 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.86 
 
 		 827 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 794 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  28.47 
 
 		 634 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 822 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  29.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  28.15 
 
 		 485 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  28.8 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  29.75 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.6 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  29.6 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 510 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  27.82 
 
 		 523 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  29.75 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.6 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  31.46 
 
 		 237 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  29.27 
 
 		 792 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 		 515 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  29.55 
 
 		 266 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>