68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2764 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  100 
 
 
215 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  99.53 
 
 
215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  99.53 
 
 
215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  96.74 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  96.74 
 
 
228 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  52.57 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  48.13 
 
 
209 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  50.88 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  48.59 
 
 
192 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  47.13 
 
 
193 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  49.13 
 
 
202 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
366 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  45.2 
 
 
214 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  44.87 
 
 
172 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  40.11 
 
 
204 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  42.31 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  37.31 
 
 
216 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  41.76 
 
 
199 aa  118  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  34.22 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  41.38 
 
 
200 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 
200 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  45.89 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  30.95 
 
 
266 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  38.71 
 
 
283 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  29.94 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  29.63 
 
 
285 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  36.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  30.4 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  27.94 
 
 
270 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  30.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  31.33 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  32.98 
 
 
294 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  36.17 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 
321 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.17 
 
 
635 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  32.46 
 
 
515 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  32.26 
 
 
275 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  23.93 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  30.77 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  31.18 
 
 
278 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  32 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  32.56 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  31.62 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 
288 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  29.01 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.56 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 
268 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 
1305 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  27.85 
 
 
265 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  29.11 
 
 
328 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  22.48 
 
 
308 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  31.73 
 
 
267 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  30.51 
 
 
275 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  30.77 
 
 
279 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  32.31 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  24.26 
 
 
265 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>