48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1662 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  100 
 
 
202 aa  417  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  67.37 
 
 
193 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  63.54 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  60.53 
 
 
192 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  59.47 
 
 
202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  59.39 
 
 
214 aa  238  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
366 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  58.9 
 
 
172 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  50 
 
 
211 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  55.85 
 
 
195 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  49.71 
 
 
215 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  49.71 
 
 
228 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  49.71 
 
 
215 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  49.13 
 
 
215 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  49.13 
 
 
215 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  49.13 
 
 
215 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  44.09 
 
 
204 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  43.37 
 
 
204 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  45.88 
 
 
199 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  40.32 
 
 
200 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  41.58 
 
 
200 aa  119  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  47.95 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  36.41 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  35.16 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  33.08 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  32.03 
 
 
223 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  32.17 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  40.22 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  26.67 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  29.46 
 
 
244 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  30.33 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  30.33 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  31.13 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  31.29 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  30.33 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  33.59 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  29.46 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  28.48 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  33.7 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
571 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  23.61 
 
 
634 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 
226 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  30.97 
 
 
453 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
515 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02037  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
515 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>