58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3168 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  98.14 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  98.6 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  98.14 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  97.21 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  97.21 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  53.14 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  47.7 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  48.13 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  48.59 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  49.71 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  50.29 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 		 366 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  45.2 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  40.11 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  37.31 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  42.35 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  34.76 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  38.2 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  46.26 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  32.03 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  30.16 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 		 273 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  36.56 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  31.93 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  29.3 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  28.89 
 
 		 285 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  23.93 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  32.46 
 
 		 515 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.17 
 
 		 635 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  29.6 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  27.21 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  31.18 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  32 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  31.62 
 
 		 282 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  32.98 
 
 		 367 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  30.11 
 
 		 278 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  25.78 
 
 		 266 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 		 288 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  27.85 
 
 		 265 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>