55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2007 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  480  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  100 
 
 
215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  97.21 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  97.21 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  97.21 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  96.74 
 
 
215 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  53.49 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  48.91 
 
 
209 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  47.95 
 
 
193 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  48.59 
 
 
192 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  49.71 
 
 
202 aa  168  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  50.29 
 
 
211 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
366 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  45.93 
 
 
214 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  46.15 
 
 
172 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  42.86 
 
 
195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  41.14 
 
 
204 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  37.31 
 
 
216 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  42.35 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  35.56 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  40.8 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  37.22 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  46.26 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  29.46 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  36.56 
 
 
283 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  31.03 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  28.57 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 
276 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  28.15 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  35.87 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 
328 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  35.87 
 
 
290 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  30.91 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 
327 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  25.78 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  23.68 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  29.94 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
268 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29 
 
 
635 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  24.81 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  29.06 
 
 
367 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 
1305 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  24.48 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  31.18 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 
294 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 
515 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
273 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  32.52 
 
 
279 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 
279 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>