63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5260 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  52.27 
 
 
223 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  54.31 
 
 
204 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  50.95 
 
 
220 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  53.37 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  50.27 
 
 
244 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  45.5 
 
 
226 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  48.48 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  44.81 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  47.06 
 
 
217 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  47.06 
 
 
217 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  47.06 
 
 
217 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  46.09 
 
 
232 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  46.4 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  45.5 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  46.19 
 
 
220 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  53.12 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  161  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  30.06 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  31.71 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  26.19 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
366 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 
515 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  30.26 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  26.53 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30.99 
 
 
515 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  24.36 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  30.41 
 
 
515 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  29.58 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.01 
 
 
484 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  28.47 
 
 
492 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.22 
 
 
1305 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  37.35 
 
 
510 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  27.54 
 
 
244 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  32.7 
 
 
195 aa  48.5  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  28.73 
 
 
634 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  31.79 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  29.53 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  25.36 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  26.39 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  30.95 
 
 
172 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  27.78 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  34.18 
 
 
292 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0744  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0804434  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  33.73 
 
 
515 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  29.08 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  28.71 
 
 
734 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.28 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  38.46 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  29.2 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  28.71 
 
 
734 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
485 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  31.19 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  31.19 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  28.76 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  24.06 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  28.76 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  25.55 
 
 
237 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>