35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  77.42 
 
 
220 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  69.27 
 
 
244 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  71.78 
 
 
198 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  52.29 
 
 
231 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  52.27 
 
 
234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  48.62 
 
 
226 aa  214  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  49.01 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  46.73 
 
 
225 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  47.94 
 
 
235 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  46.12 
 
 
239 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  44.04 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  44.1 
 
 
217 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  44.1 
 
 
217 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  44.1 
 
 
217 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  45.41 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  43.15 
 
 
220 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  39 
 
 
210 aa  167  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
366 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  28.89 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  32.03 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  28.68 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  29.55 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  28.17 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  26.8 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  27.46 
 
 
214 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  31.25 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 
634 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  24.65 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  28.95 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  23.91 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  25.37 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  30.95 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.06 
 
 
1305 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>