44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1918 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  77.42 
 
 		 223 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  72.81 
 
 		 244 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  54.09 
 
 		 231 aa  251  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  71.25 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  50.23 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  50.95 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  47.66 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  46.91 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  47.64 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  46.48 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  45.19 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  46.45 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  46.45 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  46.45 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  47.28 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  37.44 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  58.9  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  35.16 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  30.23 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  29.32 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 366 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  35.87 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  30.28 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  28.87 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  31.06 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  29.88 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.05 
 
 		 1305 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  21.77 
 
 		 280 aa  45.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1334  hypothetical protein  32.84 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  0.287859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.61 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  26.62 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.61 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 		 492 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  28.99 
 
 		 478 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.82 
 
 		 610 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>