76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3887 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  85.09 
 
 		 239 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  77.93 
 
 		 236 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  46.3 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  47.64 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  44.04 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  46.09 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  49.19 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  47.39 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  43.4 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  46.73 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  41.06 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  41.06 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  41.06 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  41.15 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  41.15 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  47.02 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  32.65 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  31.65 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  35.05 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 366 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  40.45 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.77 
 
 		 1305 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 		 515 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 		 515 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.52 
 
 		 484 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  31.61 
 
 		 674 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  31.61 
 
 		 674 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 478 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  38.46 
 
 		 515 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.3 
 
 		 392 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 792 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  25.69 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 		 485 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  35.96 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  31.61 
 
 		 681 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  30.66 
 
 		 523 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  33.02 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  28.15 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 515 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.15 
 
 		 794 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 		 523 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 		 523 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  30.77 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 		 634 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  30.82 
 
 		 635 aa  45.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 528 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 		 467 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 		 478 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  33.05 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  33.75 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  28.35 
 
 		 645 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  28.17 
 
 		 668 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  27.11 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  39.24 
 
 		 635 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  28.22 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  30 
 
 		 338 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  25.17 
 
 		 689 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  27.07 
 
 		 689 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  31.62 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  36.36 
 
 		 653 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  26.47 
 
 		 914 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  31.08 
 
 		 754 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  22.39 
 
 		 398 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.8 
 
 		 815 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>