71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3557 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1281    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  99.06 
 
 		 638 aa  1266    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  87.67 
 
 		 634 aa  1059    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  80.85 
 
 		 641 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  66.99 
 
 		 632 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  63.36 
 
 		 637 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  73.58 
 
 		 626 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  73.58 
 
 		 634 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  73.41 
 
 		 626 aa  808    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  73.58 
 
 		 626 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  73.58 
 
 		 629 aa  808    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  87.58 
 
 		 634 aa  1065    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  66.17 
 
 		 639 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  73.58 
 
 		 632 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  73.55 
 
 		 588 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  89.18 
 
 		 635 aa  1140    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  74.27 
 
 		 665 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  47.88 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  46.24 
 
 		 633 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  37.58 
 
 		 616 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  27.97 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  30.05 
 
 		 647 aa  203  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  26.37 
 
 		 637 aa  180  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  26.37 
 
 		 637 aa  180  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  26.61 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  26.61 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  34.2 
 
 		 342 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25.94 
 
 		 621 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25.94 
 
 		 621 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  25.97 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  25.97 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1253 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1338 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  30.7 
 
 		 1256 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  20.53 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  20.53 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 1256 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.76 
 
 		 1225 aa  81.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.03 
 
 		 1256 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  23.55 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1433 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  29.74 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1096 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.91 
 
 		 1431 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  26.82 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  22.87 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.81 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  30 
 
 		 1433 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  25.42 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  29.65 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  24.48 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1028 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  22.62 
 
 		 672 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  28.28 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.71 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1042 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  22.01 
 
 		 635 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  30.07 
 
 		 637 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  26.51 
 
 		 659 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  30.46 
 
 		 856 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  23.11 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  30.87 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  31.48 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  20.72 
 
 		 1257 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  21.43 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  32 
 
 		 840 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  34.29 
 
 		 704 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  30.98 
 
 		 1379 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  29.76 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 202 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  40 
 
 		 898 aa  43.9  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>