69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2972 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  63.34 
 
 
637 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  70.79 
 
 
638 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  69.74 
 
 
634 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  72.83 
 
 
638 aa  879    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  70.62 
 
 
634 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  71.12 
 
 
641 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  67.62 
 
 
632 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  65.21 
 
 
639 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  99.36 
 
 
629 aa  1234    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  99.68 
 
 
626 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  88.38 
 
 
665 aa  1031    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  71.69 
 
 
635 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1241    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  97.29 
 
 
634 aa  1113    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  99.32 
 
 
588 aa  1165    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  99.52 
 
 
632 aa  1237    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  99.68 
 
 
626 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  47.35 
 
 
633 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  47.96 
 
 
633 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  37.09 
 
 
616 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  26.58 
 
 
647 aa  214  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  27.23 
 
 
636 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  27.52 
 
 
636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  28.4 
 
 
647 aa  200  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  27.39 
 
 
637 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  27.39 
 
 
637 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  32.47 
 
 
342 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  26.4 
 
 
621 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  26.4 
 
 
621 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.95 
 
 
613 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.95 
 
 
613 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  25.15 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  25.15 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 
1256 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 
1256 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  25.42 
 
 
1256 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
1253 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
1338 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.65 
 
 
1431 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  27.5 
 
 
1225 aa  77.8  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  29.11 
 
 
1433 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
1096 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  28.32 
 
 
1433 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  26.94 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  27.27 
 
 
624 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.26 
 
 
753 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  23.73 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.47 
 
 
664 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  28.04 
 
 
260 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  22.99 
 
 
1028 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  32.5 
 
 
636 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  25.64 
 
 
856 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  25.71 
 
 
621 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  19.58 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  38.81 
 
 
672 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  27.1 
 
 
642 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  22.15 
 
 
1042 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  28.68 
 
 
659 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.43 
 
 
667 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  26.55 
 
 
637 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  27.44 
 
 
635 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.18 
 
 
632 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  19.65 
 
 
633 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  26.21 
 
 
1257 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.92 
 
 
1379 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  32.73 
 
 
658 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  27.47 
 
 
202 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  32.93 
 
 
840 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  31.07 
 
 
559 aa  44.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>