65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  97.59 
 
 
624 aa  1237    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  100 
 
 
624 aa  1289    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.34 
 
 
1433 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.45 
 
 
1431 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  26.75 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.97 
 
 
1433 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  25.6 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  26.39 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  26.1 
 
 
638 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  26.1 
 
 
638 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  34.25 
 
 
659 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  26.32 
 
 
616 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  31.98 
 
 
1225 aa  70.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  31.41 
 
 
1042 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  25.37 
 
 
641 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.92 
 
 
658 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.56 
 
 
633 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  27.82 
 
 
639 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  22.25 
 
 
633 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  32.22 
 
 
684 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  33.08 
 
 
672 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  25.13 
 
 
665 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  26.5 
 
 
632 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 
642 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  30.14 
 
 
840 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  31.25 
 
 
1028 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
1096 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
1338 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  25.83 
 
 
633 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  25.79 
 
 
632 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  30.72 
 
 
673 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  26.64 
 
 
672 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  37.14 
 
 
647 aa  57  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  29.11 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  29.31 
 
 
753 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  30.37 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
1253 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  26.28 
 
 
634 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  26.28 
 
 
588 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  26.28 
 
 
632 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  26.28 
 
 
626 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  26.28 
 
 
626 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  26.54 
 
 
637 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  25.95 
 
 
667 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  25.94 
 
 
626 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  24.55 
 
 
647 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  25.94 
 
 
629 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  37 
 
 
704 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  30.7 
 
 
664 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  29.63 
 
 
1256 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
1256 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
1256 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  33.33 
 
 
636 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  36.67 
 
 
637 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  36.67 
 
 
637 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  37.35 
 
 
342 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 
1379 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  19.89 
 
 
673 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  38.33 
 
 
856 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  26.85 
 
 
898 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  25.41 
 
 
637 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  21.19 
 
 
621 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  38.57 
 
 
346 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>