53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0828 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  34.47 
 
 		 898 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  31.12 
 
 		 856 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1042 aa  240  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1028 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  27.67 
 
 		 672 aa  221  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  27.67 
 
 		 672 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  26.64 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  26.42 
 
 		 658 aa  190  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  25.87 
 
 		 684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  26.19 
 
 		 704 aa  114  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  22.93 
 
 		 1431 aa  94.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  28.09 
 
 		 1225 aa  94.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1433 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1433 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  22.28 
 
 		 1256 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 1256 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 		 1256 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  25 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1253 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1096 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  21.76 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  24.8 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  25.54 
 
 		 647 aa  74.3  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  23.58 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.99 
 
 		 1257 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  22.9 
 
 		 667 aa  70.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  21.92 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  21.52 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  28.88 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  28.88 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  31.84 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  21.54 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  23.17 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1338 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  30.94 
 
 		 624 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  26.84 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  26.29 
 
 		 633 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  24.89 
 
 		 647 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  24.89 
 
 		 647 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  22.32 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  23.14 
 
 		 636 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.6 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.12 
 
 		 632 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  44 
 
 		 635 aa  48.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  32 
 
 		 638 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  23.62 
 
 		 642 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  33 
 
 		 634 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  33 
 
 		 634 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  27.55 
 
 		 633 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  31 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  22.26 
 
 		 621 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  31 
 
 		 638 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>