73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1228 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 1257 aa  2591    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.18 
 
 		 1225 aa  171  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1433 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.26 
 
 		 664 aa  88.2  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  23.81 
 
 		 1431 aa  88.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1096 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1338 aa  86.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1433 aa  82  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  24.4 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  23.84 
 
 		 856 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 1253 aa  76.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  19.29 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  27.92 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.26 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  21.53 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  26.95 
 
 		 632 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  20.62 
 
 		 636 aa  70.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  22.99 
 
 		 840 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  19.73 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1028 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  25.54 
 
 		 642 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  24.41 
 
 		 635 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  22.16 
 
 		 656 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  22.29 
 
 		 1256 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  26.64 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  22.69 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 1256 aa  65.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.67 
 
 		 1256 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  22.8 
 
 		 637 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  23.55 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  22.37 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  23.35 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  22.19 
 
 		 678 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  21.2 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  21.2 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  19.87 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  20.93 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1042 aa  62.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  23.11 
 
 		 898 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  25.2 
 
 		 672 aa  62  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  21.07 
 
 		 633 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  19.44 
 
 		 1238 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  21.41 
 
 		 633 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.73 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  22.3 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  19.26 
 
 		 1238 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  22.78 
 
 		 672 aa  57.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  21.74 
 
 		 634 aa  57.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  21.18 
 
 		 635 aa  57.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  19.9 
 
 		 1239 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  25.38 
 
 		 616 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  21.67 
 
 		 639 aa  55.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  25.75 
 
 		 641 aa  55.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  20.85 
 
 		 634 aa  55.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  21.97 
 
 		 637 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  25.77 
 
 		 658 aa  53.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  18.33 
 
 		 613 aa  52.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  18.33 
 
 		 613 aa  52.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  22.63 
 
 		 1379 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  20.72 
 
 		 638 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  23.2 
 
 		 621 aa  49.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  24.65 
 
 		 704 aa  48.9  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  24.59 
 
 		 659 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  19.51 
 
 		 638 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  19.68 
 
 		 667 aa  48.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  46.03 
 
 		 376 aa  47.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  29.59 
 
 		 667 aa  46.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 297 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 297 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 		 391 aa  45.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 		 391 aa  45.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 291 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 796 aa  45.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>