20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0238 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  100 
 
 
1239 aa  2296    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  94.75 
 
 
1238 aa  2013    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  59.85 
 
 
1241 aa  1080    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  95.16 
 
 
1238 aa  2006    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
1256 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  27.6 
 
 
1256 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 
1256 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  20.19 
 
 
1225 aa  99.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  31.68 
 
 
1431 aa  85.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
1253 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  31.4 
 
 
1433 aa  82  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  29.35 
 
 
1433 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.64 
 
 
1379 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  20.27 
 
 
1257 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  25.86 
 
 
1042 aa  53.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
1338 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  21.32 
 
 
673 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  26.2 
 
 
632 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  25.89 
 
 
616 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
827 aa  45.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>