52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0838 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 704 aa  1404    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  30.42 
 
 		 684 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  31.82 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1028 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  23.03 
 
 		 673 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  26.02 
 
 		 840 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1042 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  20.89 
 
 		 672 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  23.94 
 
 		 667 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  26.65 
 
 		 856 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  21.26 
 
 		 672 aa  97.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  22.4 
 
 		 898 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  20.74 
 
 		 673 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  31.61 
 
 		 633 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.42 
 
 		 753 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  35.38 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  27.91 
 
 		 1256 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  34.62 
 
 		 647 aa  62  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1338 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  24.27 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  23.56 
 
 		 659 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 1256 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 1256 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 1225 aa  58.9  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  33.08 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  33.08 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  26.16 
 
 		 616 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 1096 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1433 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.64 
 
 		 1431 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1433 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  22.13 
 
 		 647 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  22.13 
 
 		 647 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  33.71 
 
 		 635 aa  51.6  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  37 
 
 		 624 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  29.1 
 
 		 636 aa  50.8  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  29.63 
 
 		 636 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  37 
 
 		 624 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  31.46 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  31.71 
 
 		 634 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  32.46 
 
 		 342 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  24.65 
 
 		 1257 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.4 
 
 		 632 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  31.03 
 
 		 638 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 1379 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 		 1136 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  27.27 
 
 		 633 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  29.89 
 
 		 638 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  26.23 
 
 		 641 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1253 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  26.83 
 
 		 613 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  26.83 
 
 		 613 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>