More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0237 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  67.19 
 
 
1253 aa  1302    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  100 
 
 
1256 aa  2405    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  95.65 
 
 
1256 aa  2015    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  96.05 
 
 
1256 aa  2028    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  21.95 
 
 
1225 aa  277  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  28.15 
 
 
647 aa  150  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
1096 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  27.59 
 
 
636 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  27.67 
 
 
636 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  27.08 
 
 
647 aa  115  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.33 
 
 
667 aa  113  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  27.32 
 
 
1239 aa  112  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  27.21 
 
 
1238 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  20.44 
 
 
1257 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  26.4 
 
 
659 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  27.21 
 
 
1238 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  23.97 
 
 
616 aa  108  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  27.08 
 
 
637 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  27.08 
 
 
637 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  25.8 
 
 
632 aa  107  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25.82 
 
 
621 aa  104  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25.82 
 
 
621 aa  104  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.67 
 
 
753 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.75 
 
 
673 aa  100  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0259  hypothetical protein  32.14 
 
 
403 aa  98.6  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  25.42 
 
 
639 aa  97.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  28.39 
 
 
342 aa  96.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  27.02 
 
 
647 aa  96.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  27.02 
 
 
647 aa  96.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  29.39 
 
 
1028 aa  93.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  30.7 
 
 
638 aa  90.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  30.7 
 
 
638 aa  89.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  22.52 
 
 
840 aa  89.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  30.09 
 
 
1433 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  24.37 
 
 
637 aa  89  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  27.75 
 
 
641 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  23.58 
 
 
633 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  21.29 
 
 
632 aa  87.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  31 
 
 
635 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  26.79 
 
 
634 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.21 
 
 
633 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  30.06 
 
 
634 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  30.57 
 
 
1433 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.25 
 
 
1431 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.36 
 
 
587 aa  82.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  21.08 
 
 
637 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.23 
 
 
725 aa  80.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.43 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.43 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 
856 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
878 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  22.1 
 
 
642 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.96 
 
 
810 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.43 
 
 
545 aa  75.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.86 
 
 
664 aa  74.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.67 
 
 
545 aa  74.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  29.32 
 
 
626 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  29.32 
 
 
632 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  29.32 
 
 
626 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  29.32 
 
 
634 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  27.81 
 
 
658 aa  73.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  29.32 
 
 
626 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.23 
 
 
816 aa  73.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  29.32 
 
 
629 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  29.32 
 
 
588 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
1338 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  23.67 
 
 
672 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  20.63 
 
 
621 aa  72  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  24.8 
 
 
678 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
909 aa  71.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  25.77 
 
 
1241 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  20.77 
 
 
898 aa  71.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 
632 aa  70.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  25.16 
 
 
665 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 
565 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
3145 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.21 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  23.31 
 
 
636 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  27.24 
 
 
672 aa  66.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
2262 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  38.71 
 
 
545 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  30.91 
 
 
1042 aa  62.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
804 aa  61.6  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  38.1 
 
 
633 aa  61.6  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.1 
 
 
1737 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  21.31 
 
 
865 aa  61.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
824 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  21.3 
 
 
603 aa  60.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
362 aa  60.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 
643 aa  60.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
596 aa  58.9  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
1038 aa  59.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.62 
 
 
395 aa  58.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
744 aa  58.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 
2240 aa  58.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
637 aa  58.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
523 aa  58.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 
564 aa  58.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>