65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3243 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  100 
 
 
624 aa  1288    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  97.59 
 
 
624 aa  1235    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.34 
 
 
1433 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.62 
 
 
1431 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  25.52 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  27.94 
 
 
638 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  27.94 
 
 
638 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  26.19 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  25.89 
 
 
634 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  24.37 
 
 
633 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.85 
 
 
1433 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  32.56 
 
 
1225 aa  73.9  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  27.27 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  30.57 
 
 
659 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  22.8 
 
 
633 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  29.62 
 
 
639 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  32.35 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  29.32 
 
 
1042 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
632 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  35.03 
 
 
658 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 
642 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  32.33 
 
 
672 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  31.25 
 
 
1028 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  31.28 
 
 
684 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.34 
 
 
632 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  26.26 
 
 
665 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
1096 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  26.64 
 
 
840 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  30.07 
 
 
673 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  30.87 
 
 
633 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  38.1 
 
 
647 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
1338 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  30.29 
 
 
753 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
1253 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  31.5 
 
 
672 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  28.62 
 
 
637 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  29.72 
 
 
636 aa  53.9  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  25.45 
 
 
647 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  29.84 
 
 
636 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  30.88 
 
 
1379 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
1256 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
1256 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  26.96 
 
 
588 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  26.96 
 
 
626 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  26.96 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  26.96 
 
 
626 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  26.96 
 
 
632 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  29.63 
 
 
1256 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  25.95 
 
 
667 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  28 
 
 
664 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  33.33 
 
 
636 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  37 
 
 
704 aa  50.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  26.62 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  26.62 
 
 
629 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  33.96 
 
 
637 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  37.35 
 
 
342 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  33.96 
 
 
637 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  20.28 
 
 
673 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  38.33 
 
 
856 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  26.85 
 
 
898 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  23 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  27.27 
 
 
637 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  38.57 
 
 
346 aa  43.5  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>