71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0429 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1321    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  41.2 
 
 
642 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  33.33 
 
 
632 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  32.27 
 
 
637 aa  346  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  29.07 
 
 
635 aa  320  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  28.98 
 
 
621 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.55 
 
 
1225 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  24.01 
 
 
664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  20.74 
 
 
659 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1096 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
1253 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  24.22 
 
 
753 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  32.67 
 
 
1433 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  28.29 
 
 
621 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  28.29 
 
 
621 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 
1431 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  27.32 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  27.32 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  28.06 
 
 
1433 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 
1256 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
1256 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  27 
 
 
647 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  22.11 
 
 
637 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  22.11 
 
 
637 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  24.72 
 
 
672 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  27 
 
 
616 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  22.88 
 
 
1256 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  23.35 
 
 
1257 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  29.25 
 
 
633 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  25.55 
 
 
673 aa  61.6  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  20.8 
 
 
677 aa  61.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  33.01 
 
 
633 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  21.82 
 
 
673 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  27.09 
 
 
647 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 
1338 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  31.45 
 
 
342 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  22.63 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  22.7 
 
 
1028 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  30.41 
 
 
636 aa  57.4  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  29.65 
 
 
639 aa  57  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  28.8 
 
 
634 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  28.08 
 
 
636 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  20.16 
 
 
678 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  30.77 
 
 
634 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  21.45 
 
 
655 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  25.22 
 
 
898 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 
856 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  23.61 
 
 
667 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  30.87 
 
 
638 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  30.82 
 
 
641 aa  54.3  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  28.8 
 
 
635 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  30.87 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  31.93 
 
 
588 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  31.93 
 
 
634 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  23.14 
 
 
840 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 
624 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  32.5 
 
 
629 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  32.5 
 
 
626 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  32.5 
 
 
632 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  32.5 
 
 
626 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  27.65 
 
 
632 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  33.33 
 
 
624 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  32.5 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  34.38 
 
 
658 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  32.19 
 
 
665 aa  48.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.9 
 
 
667 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  29.24 
 
 
637 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  25.5 
 
 
1042 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  18.52 
 
 
678 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  20.37 
 
 
613 aa  43.9  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  20.37 
 
 
613 aa  43.9  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>