76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3469 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  70.67 
 
 		 634 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  62.62 
 
 		 637 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  97.16 
 
 		 634 aa  1210    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  84.58 
 
 		 638 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  67.11 
 
 		 632 aa  814    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  70.84 
 
 		 629 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  65.33 
 
 		 639 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  70.84 
 
 		 626 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  70.67 
 
 		 626 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  70.84 
 
 		 626 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1263    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  70.84 
 
 		 665 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  83.78 
 
 		 635 aa  1060    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  84.66 
 
 		 638 aa  1061    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  70.53 
 
 		 588 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  70.84 
 
 		 632 aa  781    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  79.4 
 
 		 641 aa  988    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  46.87 
 
 		 633 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  46.7 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  37.54 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  26.97 
 
 		 647 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  27.53 
 
 		 647 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  28.28 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  28.28 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  27.03 
 
 		 636 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  27.03 
 
 		 636 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  34.67 
 
 		 342 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  26.12 
 
 		 647 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  26.12 
 
 		 647 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  26.65 
 
 		 621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  26.65 
 
 		 621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1338 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  22.87 
 
 		 633 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  20.13 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  20.13 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 1256 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1253 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 1431 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  26.79 
 
 		 1256 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1433 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1433 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 		 1256 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  23.62 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  30.65 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 1096 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  28.45 
 
 		 753 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  30.52 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.68 
 
 		 673 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  25.89 
 
 		 624 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1042 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  26.39 
 
 		 624 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  21.7 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  22.11 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  24.74 
 
 		 1225 aa  67.8  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.73 
 
 		 632 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.71 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1028 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  28.09 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  34.58 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  30.47 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  23.83 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.35 
 
 		 1379 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.3 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  28.8 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  20.85 
 
 		 1257 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 559 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  21.48 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 202 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  33 
 
 		 840 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  33.8 
 
 		 704 aa  47.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  20.25 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  31.17 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  38.04 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 		 438 aa  44.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.8 
 
 		 280 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  36.71 
 
 		 571 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>