69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2847 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  97.95 
 
 
632 aa  1130    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  98.89 
 
 
629 aa  1120    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  70.95 
 
 
638 aa  887    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  97.77 
 
 
626 aa  1119    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  70.12 
 
 
634 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  97.45 
 
 
626 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1258    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  97.77 
 
 
626 aa  1119    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  68.95 
 
 
641 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  63.12 
 
 
639 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  72.77 
 
 
638 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  70.62 
 
 
634 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  68.15 
 
 
632 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  89.27 
 
 
665 aa  1051    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  70.19 
 
 
635 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  62.54 
 
 
637 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  99.83 
 
 
588 aa  1171    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  47.53 
 
 
633 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  46.45 
 
 
633 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  37.26 
 
 
616 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  27.15 
 
 
647 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  27.23 
 
 
636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  27.52 
 
 
636 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  28.57 
 
 
647 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  26.79 
 
 
637 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  26.79 
 
 
637 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  32.76 
 
 
342 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25.16 
 
 
621 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25.16 
 
 
621 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  25.15 
 
 
647 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  25.15 
 
 
647 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.77 
 
 
613 aa  98.6  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.77 
 
 
613 aa  98.6  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.04 
 
 
1256 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
1256 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  25.42 
 
 
1256 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
1253 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
1338 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 
1431 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  27.5 
 
 
1225 aa  77.8  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  29.11 
 
 
1433 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
1096 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  28.32 
 
 
1433 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  27.27 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.85 
 
 
753 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  27.61 
 
 
624 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  24 
 
 
673 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.47 
 
 
664 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  28.04 
 
 
260 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  31.93 
 
 
636 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  19.57 
 
 
672 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  22.99 
 
 
1028 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  26.19 
 
 
621 aa  60.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  38.81 
 
 
672 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 
856 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.79 
 
 
667 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  26.45 
 
 
642 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  28.68 
 
 
659 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  21.8 
 
 
1042 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  25.86 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.18 
 
 
632 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  19.9 
 
 
633 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  27.67 
 
 
635 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  26.21 
 
 
1257 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.92 
 
 
1379 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  32.73 
 
 
658 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  32.93 
 
 
840 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 
438 aa  44.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  31.07 
 
 
559 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>