60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2993 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1263    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1263    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  24.87 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  24.87 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  27.14 
 
 		 621 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  27.14 
 
 		 621 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  24.01 
 
 		 647 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  24.09 
 
 		 633 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  24.44 
 
 		 636 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  23.82 
 
 		 647 aa  130  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  24.26 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  22.39 
 
 		 633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  23.88 
 
 		 637 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  23.88 
 
 		 637 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  23.63 
 
 		 616 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.92 
 
 		 1225 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  21.47 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  20.03 
 
 		 632 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  21.9 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  20.53 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  20.13 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  22.08 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  23.93 
 
 		 637 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  22.96 
 
 		 639 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.24 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  20.1 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  26.44 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 		 1256 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 		 1256 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  22.31 
 
 		 1256 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  21.78 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  22.77 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  23.06 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  23.06 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  23.06 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  23.06 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  22.03 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  20.58 
 
 		 1096 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  22.89 
 
 		 634 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  22.89 
 
 		 629 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  20.53 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  24.49 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  20.55 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.86 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 		 1253 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  26.9 
 
 		 260 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  19.67 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  22.6 
 
 		 637 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1042 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  18.33 
 
 		 1257 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  19.32 
 
 		 621 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.62 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 1338 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  21.32 
 
 		 898 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  18.09 
 
 		 672 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  21.03 
 
 		 856 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1028 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  27.5 
 
 		 704 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  20.37 
 
 		 636 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1433 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>