109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0514 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  94.73 
 
 
1433 aa  2300    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  51.24 
 
 
1379 aa  993    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  97.23 
 
 
1433 aa  2380    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  100 
 
 
1431 aa  2719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
1338 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.73 
 
 
1225 aa  140  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  26.13 
 
 
647 aa  99.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  25.93 
 
 
664 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  33.06 
 
 
616 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  22.93 
 
 
840 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  26.68 
 
 
1042 aa  93.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  26.53 
 
 
637 aa  91.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  26.53 
 
 
637 aa  91.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  27.17 
 
 
673 aa  89.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  25.1 
 
 
753 aa  87.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.68 
 
 
659 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  23.75 
 
 
1257 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  25.96 
 
 
633 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  25 
 
 
672 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  30.04 
 
 
1238 aa  85.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  31.68 
 
 
1239 aa  84  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1253 aa  84.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  24.16 
 
 
633 aa  84  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  26.12 
 
 
633 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  29.62 
 
 
1238 aa  82.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  28.27 
 
 
639 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  25.42 
 
 
624 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  25.88 
 
 
636 aa  79.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  28.57 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  27.48 
 
 
856 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  29.24 
 
 
641 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  33.33 
 
 
634 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  25.61 
 
 
636 aa  78.6  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  25.09 
 
 
898 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  24.35 
 
 
647 aa  77  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
1256 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  29.34 
 
 
1256 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  31.08 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 
1256 aa  75.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  25.21 
 
 
624 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  28.64 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  24.08 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  24.08 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28.21 
 
 
632 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  27.04 
 
 
632 aa  74.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  21.2 
 
 
1028 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  29.91 
 
 
638 aa  73.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 
1096 aa  72.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  28.42 
 
 
636 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  29.09 
 
 
1241 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  29.62 
 
 
638 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  23.66 
 
 
672 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  27.78 
 
 
637 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  24.04 
 
 
642 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  26.68 
 
 
658 aa  65.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  21.04 
 
 
621 aa  62.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  21.04 
 
 
621 aa  62.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  29.29 
 
 
665 aa  62  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  24.73 
 
 
673 aa  58.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  24.58 
 
 
621 aa  58.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  27.08 
 
 
684 aa  57.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
955 aa  57  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 
678 aa  56.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
573 aa  55.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  36.46 
 
 
626 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  36.46 
 
 
626 aa  54.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 
586 aa  53.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  36.46 
 
 
632 aa  54.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  36.46 
 
 
588 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  36.46 
 
 
629 aa  54.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  36.46 
 
 
626 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  36.46 
 
 
634 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
878 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 
810 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
1486 aa  52.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  25.76 
 
 
704 aa  52.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  25.79 
 
 
637 aa  52  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
1737 aa  52  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
685 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
681 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
847 aa  51.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  34.03 
 
 
935 aa  50.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.33 
 
 
725 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 
683 aa  49.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
265 aa  49.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  40.95 
 
 
626 aa  48.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 
790 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  33.93 
 
 
955 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
274 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 
811 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.68 
 
 
790 aa  48.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
637 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
767 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.35 
 
 
945 aa  47.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
1061 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.2 
 
 
780 aa  47.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.23 
 
 
622 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.22 
 
 
535 aa  47.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  47.76 
 
 
766 aa  47  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
635 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>