78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0539 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1361    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 		 1225 aa  210  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  25.19 
 
 		 642 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.33 
 
 		 632 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  24.01 
 
 		 636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  21.8 
 
 		 635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  22.4 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  22.1 
 
 		 621 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  24.51 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1433 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1433 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.49 
 
 		 1431 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  24.84 
 
 		 647 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  24.84 
 
 		 647 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  22.02 
 
 		 655 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  25.14 
 
 		 753 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  22.92 
 
 		 616 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 1096 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1042 aa  90.5  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.26 
 
 		 1257 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  24.34 
 
 		 637 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  24.34 
 
 		 637 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  19.69 
 
 		 659 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  23.61 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  21.46 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  22.7 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  22.08 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  23.13 
 
 		 856 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  23.26 
 
 		 672 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  25 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  21.89 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  25.2 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  22.19 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  30.5 
 
 		 898 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  23.42 
 
 		 638 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  23.85 
 
 		 638 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 1338 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  28.64 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  19.83 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  25 
 
 		 1028 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  23.43 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  22.49 
 
 		 1256 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  20.39 
 
 		 673 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 1253 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  22.71 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  22.22 
 
 		 634 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  20.2 
 
 		 672 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  45.68 
 
 		 342 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1241 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  19.79 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 		 1256 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.15 
 
 		 1256 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  21.28 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  19.7 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  20.53 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  31.11 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  20.53 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  23.63 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  26.4 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  23.08 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  23.77 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  19.12 
 
 		 667 aa  55.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  26.39 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  24.27 
 
 		 704 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  20.28 
 
 		 677 aa  51.2  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  22.47 
 
 		 632 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  22.47 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  22.47 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  22.47 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  22.47 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  28.26 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  30.61 
 
 		 624 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  21.33 
 
 		 637 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  22.28 
 
 		 588 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  22.28 
 
 		 626 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  22.28 
 
 		 634 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  27.18 
 
 		 667 aa  47.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  21.88 
 
 		 678 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>