46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0857 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1395    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.82 
 
 		 658 aa  204  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1042 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  25.98 
 
 		 898 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 		 856 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  25.87 
 
 		 840 aa  180  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  26.62 
 
 		 672 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  25.59 
 
 		 672 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1028 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  26.47 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  29.7 
 
 		 704 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  24.01 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  25.59 
 
 		 753 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  25.67 
 
 		 1257 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1338 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  29.14 
 
 		 1225 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1096 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  34.62 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  24.46 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 1256 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  26.4 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  20 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  31.07 
 
 		 633 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  24.84 
 
 		 1256 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 1256 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1433 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.7 
 
 		 1431 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.17 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1433 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  22.36 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  22.36 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  29.3 
 
 		 647 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  29.51 
 
 		 636 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  29.51 
 
 		 636 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  26.45 
 
 		 647 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  36.26 
 
 		 633 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  31.25 
 
 		 633 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  37.97 
 
 		 342 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  36.23 
 
 		 632 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1253 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  28.32 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.2 
 
 		 667 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  37.33 
 
 		 639 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 		 642 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  22.31 
 
 		 632 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>