72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1934 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  68.78 
 
 		 647 aa  917    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  63.5 
 
 		 636 aa  786    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  63.5 
 
 		 636 aa  786    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  65.72 
 
 		 637 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  65.72 
 
 		 637 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1322    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  32.39 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  28.89 
 
 		 633 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  28.93 
 
 		 633 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  28.03 
 
 		 641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  28.44 
 
 		 635 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  29.89 
 
 		 639 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  28.88 
 
 		 638 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  31.54 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  28.42 
 
 		 638 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  27.53 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  27.2 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  29.84 
 
 		 637 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  25.85 
 
 		 621 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  25.85 
 
 		 621 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  27.79 
 
 		 647 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  27.79 
 
 		 647 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 626 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  28.57 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 626 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  28.57 
 
 		 632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 629 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  28.4 
 
 		 626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  32.09 
 
 		 342 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1096 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  23.82 
 
 		 613 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  23.82 
 
 		 613 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1253 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 		 1256 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 1256 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  25.65 
 
 		 1256 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  25.81 
 
 		 672 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  24.23 
 
 		 753 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  25.14 
 
 		 672 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  24.51 
 
 		 664 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.7 
 
 		 1225 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  33.54 
 
 		 659 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1042 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.96 
 
 		 673 aa  87.4  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  22.85 
 
 		 642 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1433 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  21.03 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1433 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1028 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1338 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  20.47 
 
 		 856 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  24.27 
 
 		 1431 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  19.29 
 
 		 1257 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  24.9 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  27.8 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.06 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  27 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  23.23 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.56 
 
 		 658 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  23.83 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  26.03 
 
 		 624 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  35.87 
 
 		 704 aa  59.7  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  25.19 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  19.58 
 
 		 898 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  26.45 
 
 		 684 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  22.83 
 
 		 621 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  25.57 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  26.79 
 
 		 667 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  23.3 
 
 		 673 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>