19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3999 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1390    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  32.02 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  28.74 
 
 		 677 aa  271  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  29.06 
 
 		 673 aa  270  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  28.32 
 
 		 656 aa  260  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  26.21 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  25.96 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  22.06 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  25.4 
 
 		 659 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.89 
 
 		 1225 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  20.31 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.2 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  20.66 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  25.2 
 
 		 1257 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  20.2 
 
 		 642 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  21 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  20 
 
 		 647 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  20.25 
 
 		 634 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>