15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06975 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1353    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  32.36 
 
 
677 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  33.74 
 
 
678 aa  362  9e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  33.99 
 
 
673 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  28.27 
 
 
667 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  26.25 
 
 
678 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  26.25 
 
 
672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  23.78 
 
 
656 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  21.66 
 
 
655 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  21.98 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  20.68 
 
 
1225 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  19.12 
 
 
664 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  23.61 
 
 
636 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.19 
 
 
659 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  19.68 
 
 
1257 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>