15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06980 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  100 
 
 
677 aa  1374    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  48.26 
 
 
678 aa  656    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  38.75 
 
 
673 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  32.65 
 
 
667 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  26.83 
 
 
678 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  28.74 
 
 
672 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  27.64 
 
 
667 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 
656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  20.31 
 
 
655 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  20.8 
 
 
636 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  20.72 
 
 
642 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  20.2 
 
 
664 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  21.95 
 
 
1225 aa  50.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 
1096 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  23.12 
 
 
1257 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>