17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0540 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  100 
 
 
655 aa  1361    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  22.71 
 
 
673 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  21.04 
 
 
678 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  21.58 
 
 
667 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  21.51 
 
 
1225 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.02 
 
 
664 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  20.31 
 
 
677 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  22.03 
 
 
656 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  22.06 
 
 
672 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  19.97 
 
 
678 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  21.66 
 
 
667 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  21.45 
 
 
636 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  21.16 
 
 
642 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  24.35 
 
 
636 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  20 
 
 
632 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  24.35 
 
 
636 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  19.53 
 
 
637 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>