15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1592 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 667 aa  1360    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  31.89 
 
 		 678 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  32.93 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  31.87 
 
 		 656 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  29.62 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  29.59 
 
 		 672 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  28.15 
 
 		 667 aa  280  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  27.64 
 
 		 677 aa  257  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  21.26 
 
 		 655 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  24.42 
 
 		 1225 aa  88.6  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  19.79 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.91 
 
 		 1257 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  20.43 
 
 		 632 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  20.47 
 
 		 647 aa  47.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  25.62 
 
 		 672 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>