More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2045 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  100 
 
 		 506 aa  973    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 513 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 		 583 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 555 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  34.67 
 
 		 503 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  32.54 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 488 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  31.01 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.91 
 
 		 516 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 564 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 473 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  31.4 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 486 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  32.82 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 479 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 505 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 480 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 487 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 512 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 509 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  32.71 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 522 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.54 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  29.13 
 
 		 476 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 484 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.3 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.55 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4938  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 		 525 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 457 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>