More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5411 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 521 aa  1010    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  88.5 
 
 		 532 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70 
 
 		 587 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  68.94 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  68.9 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  67.23 
 
 		 519 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  67.89 
 
 		 518 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  67.23 
 
 		 523 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 		 511 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  62.34 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  62.34 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  62.34 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.66 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 574 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.73 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.33 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  34.61 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  79.55 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.12 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 522 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  82.26 
 
 		 243 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.62 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 452 aa  193  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.23 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.24 
 
 		 532 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 480 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 478 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 520 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.39 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 525 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 505 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  31.85 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 506 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.29 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  29 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6092  major facilitator superfamily permease  35.86 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 515 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  30.75 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.17 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.78 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 536 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 478 aa  170  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 538 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>