More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3371 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
513 aa  980    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.81 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
516 aa  273  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  39.16 
 
 
523 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  41.65 
 
 
518 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
523 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  38.64 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  38.29 
 
 
538 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  41.22 
 
 
521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  38.48 
 
 
535 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.36 
 
 
584 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  38.95 
 
 
537 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  39.95 
 
 
541 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  39.95 
 
 
541 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  39.45 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  39.59 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  36.58 
 
 
500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 
469 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  41.49 
 
 
461 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  41.08 
 
 
460 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
509 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
503 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.17 
 
 
528 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 
516 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  40.39 
 
 
455 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  36.17 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  35.96 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 
522 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  34.21 
 
 
512 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  34.06 
 
 
519 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  32.77 
 
 
510 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.95 
 
 
522 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  34.21 
 
 
512 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  34.21 
 
 
512 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  34.21 
 
 
512 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  34.26 
 
 
512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  32.86 
 
 
510 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
515 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 
505 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  33.48 
 
 
529 aa  193  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.11 
 
 
519 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 
527 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
574 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.18 
 
 
553 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.92 
 
 
582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  42.86 
 
 
516 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.72 
 
 
521 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  35.89 
 
 
506 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.91 
 
 
467 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.04 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  36.71 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 
521 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
504 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  36.46 
 
 
519 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
461 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.58 
 
 
532 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.83 
 
 
509 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
511 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 
480 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
484 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
478 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
478 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
511 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  27.22 
 
 
507 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.33 
 
 
514 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  26.79 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 
511 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
528 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
486 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 
489 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  32.99 
 
 
418 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  35.7 
 
 
523 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 
452 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 
537 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.84 
 
 
469 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  26.87 
 
 
537 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  26.87 
 
 
537 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  26.87 
 
 
537 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.87 
 
 
537 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 
522 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.38 
 
 
513 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 
471 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 
478 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.27 
 
 
513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>