More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6092 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6092  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 473 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 510 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 521 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.22 
 
 		 582 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.48 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.34 
 
 		 532 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 587 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 512 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.78 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.1 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.78 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 512 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 480 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 528 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.83 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.54 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 574 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.3 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 516 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 539 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.75 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 512 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 514 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 551 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 538 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 478 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  34.46 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 512 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.5 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5269  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  26.67 
 
 		 511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 567 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3524  major facilitator family multidrug efflux transporter  27.71 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>