More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2532 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  66.33 
 
 		 196 aa  275  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  66.33 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  56.12 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  55.21 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  51.32 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  53.37 
 
 		 184 aa  200  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  53.3 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  51.55 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  45.79 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  44.97 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  38.92 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.41 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  42.13 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  40.1 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  42.94 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.5 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.84 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  37.7 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  39.46 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  37.5 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.15 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.18 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  38.25 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.02 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  36.81 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  39.43 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.2 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.46 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  35.05 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.86 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  36.51 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  40.46 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  37.16 
 
 		 171 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.53 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  37.5 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  37.99 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  37.43 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.06 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  37.93 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  38.51 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  36.78 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.56 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.41 
 
 		 164 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  36.36 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  38.59 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.41 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  37.36 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  35.84 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  37.21 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.65 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  36.69 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.65 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  33.7 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  33.7 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  35.39 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  38.82 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  39.77 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  37.14 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  36.75 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  36.31 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  35.8 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  38.29 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  37.28 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  37.87 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.01 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  38.92 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  35.75 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  36.07 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  40.43 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  38.24 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  38.07 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.72 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  33.14 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.02 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  38.98 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  38.12 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.73 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  37.57 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.13 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  35.71 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  37.06 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.73 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  35.2 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.59 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  36.31 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  37.16 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.36 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  37.93 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  36.05 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  36.05 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  34.97 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  36.31 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  36.87 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  36.05 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.29 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>