More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2345 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  46.68 
 
 		 697 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  77.23 
 
 		 727 aa  1162    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 729 aa  1514    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  45.84 
 
 		 717 aa  641    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.65 
 
 		 714 aa  666    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.86 
 
 		 727 aa  668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  46.81 
 
 		 722 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  47.91 
 
 		 714 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  47.22 
 
 		 734 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  45.82 
 
 		 695 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  72.24 
 
 		 723 aa  1102    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  47.8 
 
 		 695 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  47.8 
 
 		 695 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  62.05 
 
 		 724 aa  914    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.37 
 
 		 699 aa  648    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  47.71 
 
 		 712 aa  668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  44.97 
 
 		 727 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  46.53 
 
 		 723 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  62.28 
 
 		 732 aa  945    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  61.72 
 
 		 728 aa  916    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  46.87 
 
 		 716 aa  665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.45 
 
 		 695 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.99 
 
 		 714 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  57.88 
 
 		 729 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  48.11 
 
 		 721 aa  672    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  47.33 
 
 		 713 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  45.54 
 
 		 726 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  55.74 
 
 		 728 aa  844    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  48.58 
 
 		 697 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  46.8 
 
 		 705 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  45.82 
 
 		 701 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  44.94 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  45.35 
 
 		 726 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  45.35 
 
 		 718 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  45.09 
 
 		 726 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  44.26 
 
 		 723 aa  632  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  47.09 
 
 		 711 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.51 
 
 		 695 aa  627  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  45.75 
 
 		 721 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  45.28 
 
 		 723 aa  625  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  44.84 
 
 		 697 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  44.6 
 
 		 725 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  43.27 
 
 		 722 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  44.04 
 
 		 733 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  44.22 
 
 		 696 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.44 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  44.32 
 
 		 725 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  45.11 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  42.57 
 
 		 730 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  45.16 
 
 		 730 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  46.03 
 
 		 723 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  43.27 
 
 		 724 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  44.46 
 
 		 706 aa  610  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.51 
 
 		 702 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  43.21 
 
 		 729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  45.66 
 
 		 703 aa  604  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  41.28 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  41.07 
 
 		 699 aa  537  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.46 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.03 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.19 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.41 
 
 		 716 aa  442  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  26.88 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  28.37 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  29.02 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  32.14 
 
 		 474 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.68 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  36.46 
 
 		 473 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.95 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  33.96 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  29.3 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.86 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  31.62 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  32.35 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  29.24 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  27.74 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  28.66 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.37 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  27.65 
 
 		 439 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  29.34 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  33.61 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.86 
 
 		 445 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  31.37 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  31.82 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.69 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.68 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  35.11 
 
 		 450 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  35.11 
 
 		 450 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  35.11 
 
 		 450 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 445 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.09 
 
 		 447 aa  55.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  33.01 
 
 		 455 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.53 
 
 		 439 aa  54.7  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 		 475 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>