More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2754 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  99.56 
 
 
450 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 
450 aa  899    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 
450 aa  899    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  73.74 
 
 
453 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  69.11 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  47.83 
 
 
437 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  47.6 
 
 
437 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  47.6 
 
 
437 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  46.7 
 
 
442 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  49.32 
 
 
452 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  40.04 
 
 
496 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  38.64 
 
 
455 aa  240  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  36.67 
 
 
525 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  37.87 
 
 
442 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  37.53 
 
 
469 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  31.79 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  31.79 
 
 
443 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.32 
 
 
445 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  31.85 
 
 
443 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  28.26 
 
 
448 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  29.82 
 
 
448 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  31.83 
 
 
447 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  27.21 
 
 
451 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  30.03 
 
 
448 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  29.64 
 
 
443 aa  150  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  28.79 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  30.88 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  30.12 
 
 
449 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  28.44 
 
 
450 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  29.87 
 
 
444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  32.42 
 
 
447 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.99 
 
 
443 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.26 
 
 
444 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  30.41 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  29.47 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
452 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  29.75 
 
 
464 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  30.51 
 
 
446 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.82 
 
 
444 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.21 
 
 
445 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 
444 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.02 
 
 
446 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  31.69 
 
 
444 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  29.38 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  27.95 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  31.08 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  29.26 
 
 
865 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  30.11 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  29.24 
 
 
432 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  27.95 
 
 
445 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  29.4 
 
 
452 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.47 
 
 
444 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  26.91 
 
 
444 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  28.36 
 
 
444 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  27.76 
 
 
444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  29.91 
 
 
446 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  27.76 
 
 
444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30.98 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.96 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  28.22 
 
 
443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  26.96 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  27.93 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  28.94 
 
 
442 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.43 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  29.35 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.46 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  27.47 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  27.41 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  32.12 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  30.03 
 
 
444 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.32 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  30.65 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.05 
 
 
447 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  30.66 
 
 
451 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  25.34 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  28.96 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  31.55 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  25.85 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  27.11 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  30.06 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  30.07 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  31.85 
 
 
444 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  27.45 
 
 
446 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  30.29 
 
 
445 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  30.33 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  29.14 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  27.46 
 
 
443 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  31.84 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  27.17 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>