More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0166 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  73.02 
 
 		 442 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  66.02 
 
 		 459 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 464 aa  969    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  78.44 
 
 		 463 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  65.23 
 
 		 444 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  65.91 
 
 		 444 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  64.09 
 
 		 444 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  63.64 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  61.17 
 
 		 444 aa  591  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  59.82 
 
 		 446 aa  557  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  51.39 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  49.77 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  42.51 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  43.12 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  42.89 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  42.73 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  43.97 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  41.53 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  42.14 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  42.14 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  40.49 
 
 		 453 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  42.69 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  41.53 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  40.84 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  40.34 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  41.36 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  40.84 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  43.02 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  42.76 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  41.47 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  41.32 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  41.51 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  41.44 
 
 		 435 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  42.69 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  40.5 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  42.01 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  42.01 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  42.01 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  41.44 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  42.17 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  42.23 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  41.07 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  42.66 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  40.32 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  38.7 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  39.73 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  38.7 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  38.7 
 
 		 451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  39.47 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  39.22 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  36.81 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  38.31 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  39.69 
 
 		 444 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  36.9 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  37.55 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  36.68 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  38.12 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  38.89 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.53 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  37.53 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  37.31 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  36.54 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.27 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  36.84 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  35.04 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  37.25 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  35.41 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.5 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  37.72 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  35.55 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.89 
 
 		 441 aa  267  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  38.21 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  38.77 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  37.72 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  36.68 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  36.68 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  38.73 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  35.02 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  36.77 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  36.32 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.67 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 444 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  37 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  36.58 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.89 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  36.46 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  36.44 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  35.81 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.52 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  35.68 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  36.89 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  37.06 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  35.9 
 
 		 443 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  36.52 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  34.15 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.14 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>