More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2635 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  69.28 
 
 		 432 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  68.13 
 
 		 453 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 435 aa  907    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  67.67 
 
 		 432 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  68.36 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  68.36 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  68.59 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  66.51 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  63.22 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  61.61 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  62.07 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  61.61 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  62.07 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  62.04 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  62.61 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  60.73 
 
 		 438 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  44.29 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  43.08 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  40.72 
 
 		 451 aa  329  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  44.67 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  39.32 
 
 		 444 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  40.66 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  43.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  43.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  43.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  38.85 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  38.86 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  41.44 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  40.66 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  41.2 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  41.59 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  40.23 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  40.77 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  42.18 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  38.27 
 
 		 453 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  42.15 
 
 		 435 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  39.46 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  39.09 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  38.83 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  38.6 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  38.6 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  38.19 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  39.77 
 
 		 451 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  39.54 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  39.54 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  37.05 
 
 		 453 aa  282  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  36.44 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  36.78 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  36.28 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.36 
 
 		 442 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 444 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.35 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  35.9 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.36 
 
 		 444 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.24 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  34.62 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.16 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.67 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.28 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.95 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  35.97 
 
 		 448 aa  249  8e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.83 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.19 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.15 
 
 		 448 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.86 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.33 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.24 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.71 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.54 
 
 		 447 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.49 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  34.74 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  35.38 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 		 451 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  34.3 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  35.41 
 
 		 449 aa  239  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  35.27 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.96 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  34.98 
 
 		 456 aa  236  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  34.83 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  34.61 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  34.23 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 		 446 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.33 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>