More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2498 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 446 aa  931    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  61.12 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  61.59 
 
 		 463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  59.64 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  58.5 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  59.82 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  58.96 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  58.65 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  59.1 
 
 		 442 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  59.59 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  45.73 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  40.9 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  40.45 
 
 		 451 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.12 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.68 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  41.88 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  41.42 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  41.42 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  40.27 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  41.63 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  37.98 
 
 		 453 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  40.23 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  40.77 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  41.19 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  39.4 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  42.56 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  42.56 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  42.56 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  40.09 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  38.07 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  41.08 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  40.9 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  39.73 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  40.32 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  39.41 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  39.72 
 
 		 432 aa  306  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  41.06 
 
 		 436 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  39.26 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  39.59 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  39.05 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  36.94 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  38.89 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  39.49 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  38.55 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.98 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  38.62 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.96 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  38 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  37.61 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  37.31 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.96 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.66 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  36.02 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  35.35 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  40.04 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.97 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  35.56 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  36.91 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  37.67 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  35.75 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.99 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.55 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  36.75 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.6 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.25 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  35.28 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  35.45 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  35.79 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 446 aa  252  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 446 aa  252  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.52 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  33.99 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  36.26 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  37 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  36.44 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.96 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  35.79 
 
 		 453 aa  249  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.15 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  35.35 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.78 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  36.26 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  34.66 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.53 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>