More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1300 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  75.34 
 
 		 456 aa  658    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  82.8 
 
 		 436 aa  720    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  82.8 
 
 		 436 aa  720    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  82.8 
 
 		 436 aa  720    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  89.43 
 
 		 435 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 435 aa  893    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  63.88 
 
 		 480 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  43.08 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  44.09 
 
 		 463 aa  343  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  41.32 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  43.99 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  41.81 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  43.76 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  42.82 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  40.67 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  42.69 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  40.67 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  40.22 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  41.19 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  40.04 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  43.99 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  42.53 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  41.95 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  43.31 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  39.68 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  41.28 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  42.08 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  40.6 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  42.08 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  40.82 
 
 		 435 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  40.49 
 
 		 461 aa  319  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  43.99 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  40.36 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  40.6 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  38.39 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  40.65 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  42.12 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  38.08 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  41.95 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.28 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.04 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  40.77 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  37.78 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  37.78 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  37.56 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  38.06 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  35.55 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  35.18 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 456 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.77 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.66 
 
 		 441 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  34.24 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.84 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  34.89 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  31.56 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  34.22 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.51 
 
 		 445 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.78 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.91 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.72 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.28 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  31.7 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  32.81 
 
 		 445 aa  206  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.7 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.57 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  32.44 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 		 453 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.78 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.22 
 
 		 443 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  32.51 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  32.81 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  34.24 
 
 		 444 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  34.09 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  32.66 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.22 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  32.96 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  32.74 
 
 		 444 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>