More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3034 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  68.19 
 
 		 442 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  78.44 
 
 		 464 aa  759    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 463 aa  953    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  69.3 
 
 		 459 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  65.15 
 
 		 444 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  65.15 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  63.78 
 
 		 444 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  61.56 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  60.27 
 
 		 444 aa  564  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  61.59 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  52.55 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  53.01 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  43.85 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  44.54 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  45.37 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  45.09 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  43.12 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  42.28 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  44.52 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  44.52 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  42.82 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  43.68 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  44.29 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  41.24 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  42.96 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  43.16 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  43.53 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  44.09 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  43.29 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  45.29 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  45.29 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  45.29 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  43.67 
 
 		 456 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  43.82 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  43.76 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  42.37 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  44.04 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  40.95 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  40.72 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  40.87 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  40.72 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  41.86 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  40.27 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  39.95 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  40.88 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  40.73 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  38.57 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  38.62 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  38.53 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  38.62 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  40.95 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  38.04 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  40.23 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  38.78 
 
 		 446 aa  280  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  38.56 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  39.37 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  39 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  39.33 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.17 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  38.84 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.61 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  37.92 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  37.64 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  38.48 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  39.06 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  36.97 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  37.37 
 
 		 446 aa  266  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  36.84 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  37.02 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  37.04 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  37.02 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  37.44 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  39.2 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  37.75 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  40.75 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  36.85 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  37.56 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  38.12 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  38.07 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  37.17 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  38.17 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  38.07 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  37.58 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  37.36 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.73 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  38.74 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  37.86 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  38.2 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  36.89 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  36.96 
 
 		 442 aa  259  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  38.88 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  37.14 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>