More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5433 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  99.78 
 
 
451 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  100 
 
 
451 aa  930    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  100 
 
 
451 aa  930    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  60.36 
 
 
452 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  51.35 
 
 
453 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  52.1 
 
 
455 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  50 
 
 
451 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  52.35 
 
 
457 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  52.94 
 
 
461 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  51.34 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  51.34 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  51.11 
 
 
453 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  39.32 
 
 
444 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  40.41 
 
 
444 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  42.27 
 
 
444 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  40 
 
 
444 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  40.74 
 
 
458 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  38.26 
 
 
444 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  40.72 
 
 
442 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  38.7 
 
 
464 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  40.72 
 
 
463 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  38.89 
 
 
459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  40.89 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  40.89 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  40.89 
 
 
453 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  39.86 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  39.55 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  41.19 
 
 
432 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  39.36 
 
 
435 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  40 
 
 
432 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  39.54 
 
 
435 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  40.32 
 
 
432 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  38.69 
 
 
435 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  38.85 
 
 
432 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  37.13 
 
 
434 aa  292  9e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  41.42 
 
 
432 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.55 
 
 
435 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  37.7 
 
 
461 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  36.81 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  36.2 
 
 
448 aa  280  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  38.02 
 
 
448 aa  280  6e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  38.01 
 
 
436 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 
443 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  37.76 
 
 
432 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  38.06 
 
 
438 aa  276  8e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  36.59 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  35.36 
 
 
447 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  36.94 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  36.94 
 
 
444 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  36.71 
 
 
444 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.82 
 
 
444 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  37.78 
 
 
435 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  36.71 
 
 
444 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  36.71 
 
 
444 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  36.71 
 
 
444 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  36.71 
 
 
444 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  36.71 
 
 
444 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.62 
 
 
444 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.69 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 
444 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 
444 aa  263  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 
444 aa  263  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 
443 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.07 
 
 
445 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.6 
 
 
446 aa  260  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
445 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.74 
 
 
442 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 
444 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 
443 aa  259  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.12 
 
 
444 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.96 
 
 
442 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 
444 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
440 aa  256  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  37.17 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.2 
 
 
448 aa  252  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  37.2 
 
 
446 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  35.01 
 
 
449 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  37.56 
 
 
436 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  37.28 
 
 
456 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  37.56 
 
 
436 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  37.56 
 
 
436 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.99 
 
 
445 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.44 
 
 
447 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  36.5 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 
449 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 
444 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 
433 aa  243  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 
451 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.39 
 
 
444 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.2 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 
439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  35.38 
 
 
452 aa  239  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.33 
 
 
443 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 
444 aa  239  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>